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蛋白质N端测序
服务介绍:
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服务介绍
Service Introduction
表达纯化后的蛋白产物,特别是蛋白品的分析过程中,需要对蛋白的末端进行验证,以保证表达纯化产物的N端和C端序列准确。Edman降解法是蛋白的N端序列分析中非常成熟的方法之一,得到广泛应用。易科学采用岛津公司最新推出的 edman测序系统,为广大科研工作者提供纯化后蛋白产物、蛋白品、抗体以及蛋白疫苗的N端测序服务。采用我们的测序系统,可以测定N端30个氨基酸的序列信息。采用特定的蛋白上样系统,我们最多可以测定N端的60-70个氨基酸。
我们还通过LC-MS/MS技术进行N-端测序的平台,可以测出封闭和修饰的蛋白质末端,与Edman降解法形成互补,保证N端测序服务的顺利进行。
可以对下列生物样品进行测序:
1. 蛋白表达产物的验证:重组蛋白插入位点和表达顺序是否正确;蛋白品质量控制;
2. 细胞株建立和发酵过程中蛋白产物的验证:验证细胞株建立和发酵过程中蛋白产物N端甲硫氨酸和信号肽是否正确处理;
3. 蛋白降解/酶切分析:对降解/酶切形成的新蛋白片段N端进行分析,确定断裂/酶切位点;
4. De-novo测序:对于蛋白数据库中不存在的全新蛋白序列进行分析。
样品要求:
我们的技术平台可以对两种类型的样品进行分析:PVDF膜和溶液样品。
PVDF膜类样品的准备过程
(1)对蛋白样品进行1D或者2D跑胶
(2)将蛋白胶上的样品转移至PVDF膜上;注意:千万不要使用硝酸纤维素膜(Nitrocellulose membranes)
(3)在此过程中请佩戴手套和头套,避免自身角蛋白对测序结果的影响
(1)染色过程中可以使用考马斯亮蓝或者立春红对PVDF膜进行染色;注意:千万不要使用银染的方法进行染色
(2)染色完成之后,可以使用双蒸水对PVDF膜进行清洗
(1)如果转膜的缓冲液中含有甘氨酸,需要对PVDF膜进行多次冲洗,以避免甘氨酸对后续分析的影响
(2)更详细的样品准备步骤与,见Edman测序样品准备Protocol(下划线部分加入超链接)
(1)PVDF膜染色后,靶条带清晰可见,用洁净的解剖刀将靶蛋白条带切下
(2)在蛋白量允许的情况下,可以准备2-3条靶条带以增加靶蛋白的量
(1)密闭包装后,冰袋运输即可
溶液样品的准备过程:
(1)样品纯度要>90%,样品需要量在1-10ug, 样品准备过程全程佩戴口罩和头套,避免角蛋白的影响。
(2)Buffer中不要使用表面活性剂,并尽可能降低溶液的盐浓度
(3)Tris, glycine, guanidine, glycerol, sucrose, ethanolamine, SDS, Triton, X-100, Tween和其他的去垢剂, ammonium sulfate 和其他的铵盐均会对后续的氨基酸鉴定产生影响,在样品准备过程中要避免使用
(1)液体样品推荐干冰运输
(2)液体样品也可以在冷冻抽干或者真空抽干后,冰袋运输
服务周期:
服务周期:2-4周